O Porto de Pesca fica situado no troço final da confluência do braço sul do Rio Mondego com o Canal principal. O Porto encontra-se subdividido em zonas de atividade diferenciadas, sendo possível distinguir as seguintes:
• Zona de descarga e armazenamento
• Zona de aprovisionamento
• Zona de aprestamento e estacionamento
• Zona de reparações
• Zona administrativa e de controlo
• Zona de indústria da pesca